Trường hợp giá chuyển nhượng ghi trên hợp đồng và kê khai trên tờ khai thuế thấp hơn giá do UBND cấp tỉnh quy định hoặc thấp hơn giá tính lệ phí trước bạ do UBND cấp tỉnh quy định tại thời điểm hợp đồng chuyển nhượng có hiệu lực thì áp dụng thuế suất 2% tính trên giá do UBND tỉnh quy định.
Trong việc nộp lệ phí trước bạ, Thông tư 68 ngày 26-4-2010 của Bộ Tài chính hướng dẫn: Giá trị đất tính lệ phí trước bạ là giá chuyển nhượng quyền sử dụng đất thực tế do người nộp thuế kê khai. Trường hợp người nộp thuế kê khai không đúng giá thực tế chuyển nhượng thì xác định giá đất căn cứ vào giá 1 m2 đất do UBND tỉnh quy định.
Như vậy, việc cơ quan thuế sẽ căn cứ giá chuyển nhượng ghi trên hợp đồng chuyển nhượng đất để thu thuế thu nhập cá nhân và lệ phí trước bạ theo cách tính nêu trên